102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 		 148 aa  85.1  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  33.57 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  36.15 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  35.96 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  35.65 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 158 aa  51.6  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  36 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  36 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  36 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  39.02 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.97 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 161 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  25.86 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  35.9 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  24.72 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  28.43 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.88 
 
 		 162 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 145 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  27.38 
 
 		 149 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  46.51 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  23.6 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 156 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 159 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 157 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 168 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.79 
 
 		 139 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  39.29 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  26.75 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  28.07 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>