More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3741 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  100 
 
 
173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  87.65 
 
 
170 aa  302  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  87.65 
 
 
170 aa  302  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  87.65 
 
 
170 aa  302  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  82.84 
 
 
176 aa  292  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  82.84 
 
 
176 aa  290  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  82.25 
 
 
176 aa  288  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  80.7 
 
 
176 aa  286  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  80.7 
 
 
176 aa  286  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  80.7 
 
 
176 aa  286  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  80.7 
 
 
176 aa  286  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  81.66 
 
 
176 aa  285  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  80.12 
 
 
176 aa  284  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  74.25 
 
 
170 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 
171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  71.6 
 
 
170 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  71.69 
 
 
171 aa  248  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  28.77 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  31.21 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.23 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  38.71 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 
148 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  25.16 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
192 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
139 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 
149 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  25.86 
 
 
261 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
178 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 
152 aa  52  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 
182 aa  52  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
212 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
156 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  33.05 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
142 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
169 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
142 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
139 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  26.25 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>