More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3200 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  87.65 
 
 		 173 aa  302  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  80.12 
 
 		 176 aa  273  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  80.12 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  79.52 
 
 		 176 aa  269  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  79.52 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  79.52 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  79.52 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  79.52 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  78.92 
 
 		 176 aa  267  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  78.92 
 
 		 176 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 171 aa  247  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  72.29 
 
 		 170 aa  245  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  72.29 
 
 		 171 aa  244  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  69.88 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  30.82 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  31.88 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  40.31 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.36 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  32.59 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  35.48 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  32.62 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.21 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.34 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>