174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2807 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  35.37 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4672  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  35.25 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  28.31 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3286  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000146824  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  34.75 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  34.75 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  34.75 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  31.58 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  33.03 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  32.46 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  30.7 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.82 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.78 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  28.95 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  28.85 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.4 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  29.73 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.74 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  28.72 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 136 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  41.94 
 
 		 289 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  26.55 
 
 		 154 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.36 
 
 		 177 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>