28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4672 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4672  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  94.35 
 
 		 177 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  74.58 
 
 		 177 aa  283  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3286  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000146824  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30 
 
 		 283 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  39.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 170 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 149 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.26 
 
 		 319 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>