More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5322 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.2 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  27.07 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  29.32 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.89 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  26.9 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  31.94 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.46 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  24.11 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  30.19 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>