More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1784 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 212 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  66.87 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  66.87 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  66.87 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  66.87 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  35.37 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  29.8 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.68 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  28.21 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  40.66 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  28.57 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  27.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  25.17 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  27.97 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  29.92 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  24.24 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  29.92 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  29.92 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.46 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  24.5 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  28.08 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  28.67 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  26.47 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>