More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2668 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  286  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  86.86 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  61.59 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  63.93 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  60.33 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  60.33 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  54.33 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  54.55 
 
 		 160 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  54.55 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 137 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  54.1 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 277 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  41.59 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  34.75 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  39.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  25.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  29.91 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  39.74 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.63 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>