266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2951 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  57.69 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  44.62 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  51.79 
 
 		 277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  49.15 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  48.31 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  46.49 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  46.09 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  46.36 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 142 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  43.12 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  40.87 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  35.48 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  37.68 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  40 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  33.78 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>