More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1559 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  71.76 
 
 
142 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  71.76 
 
 
142 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  71.76 
 
 
142 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  60.48 
 
 
145 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
140 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.12 
 
 
169 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
194 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
167 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.3 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  31.19 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  35.65 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
199 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 
177 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  26.79 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
244 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
303 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
172 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
223 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
169 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  28.36 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.18 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  35.63 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
174 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
154 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
191 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.2 
 
 
162 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  34.34 
 
 
191 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  33.02 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
186 aa  50.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>