270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2239 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
156 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
156 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 
156 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
156 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  43.93 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  37.82 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  31.3 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  41.07 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
322 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
171 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
313 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  30.68 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  38.18 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  36 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  41.94 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.27 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  47.37 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.37 
 
 
325 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  28.4 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
187 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  26.51 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  46.43 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>