75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4123 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  340  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  31.79 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  34.38 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  34.94 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  23.01 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 149 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 163 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  38.03 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  31.68 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  36.62 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.79 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>