60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0875 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  84.62 
 
 		 164 aa  260  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  83.97 
 
 		 188 aa  260  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 186 aa  241  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  79.19 
 
 		 193 aa  238  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  73.42 
 
 		 161 aa  226  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  71.34 
 
 		 168 aa  223  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  68.46 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 149 aa  117  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 157 aa  44.3  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 167 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 143 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  43.86 
 
 		 163 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  29.03 
 
 		 109 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  28.32 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  45.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 127 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  32.18 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>