107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4686 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
168 aa  337  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  80.98 
 
 
165 aa  261  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  71.34 
 
 
166 aa  223  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  76.71 
 
 
161 aa  223  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  69.94 
 
 
188 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  71.07 
 
 
164 aa  217  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  73.83 
 
 
193 aa  213  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  68.32 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  68.71 
 
 
179 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
149 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
128 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
144 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  46.94 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
171 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  40 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
127 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
165 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 
156 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
172 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  32.97 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  32.91 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  37.18 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
244 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  32.91 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  30.11 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  48.08 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
142 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  36.62 
 
 
157 aa  44.3  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  45.45 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  30.68 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  33.01 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  38.33 
 
 
261 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
194 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
159 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
187 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 
142 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
183 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
150 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
151 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 
150 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.46 
 
 
138 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  26.32 
 
 
137 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.41 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
186 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
233 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  37.31 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  27.08 
 
 
145 aa  40.8  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  45.24 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
143 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
143 aa  40.8  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>