110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2388 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  340  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 149 aa  157  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 193 aa  141  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  51.37 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 186 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  44.58 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  48.43 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  36.54 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 128 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  33.57 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  43.4 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  41.67 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  44.23 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  45.1 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 153 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 175 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 171 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  19.81 
 
 		 152 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  24.79 
 
 		 135 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  32.18 
 
 		 261 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>