142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1500 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  319  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  30.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  28.93 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  22.4 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  24.21 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.13 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  29.27 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  26.87 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  24.35 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  23.45 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  29.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  22.47 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  22.09 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  26.58 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 167 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 143 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 152 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>