105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3957 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  80.98 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 166 aa  222  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  75.33 
 
 		 193 aa  219  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  74.83 
 
 		 161 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 188 aa  218  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  70.51 
 
 		 164 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  70.7 
 
 		 186 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  65.61 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  50.75 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 127 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 193 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  30.43 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  39.68 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  31.18 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  41.82 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  40.68 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.36 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 172 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  40 
 
 		 160 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 303 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  26.04 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>