286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3964 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  283  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  283  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  283  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  62.94 
 
 
144 aa  184  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
139 aa  174  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  61.54 
 
 
147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  58.78 
 
 
148 aa  153  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
175 aa  84.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  43.31 
 
 
144 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 
140 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 
156 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  41.28 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  43.96 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  42.7 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
169 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  34.09 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
168 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  35.51 
 
 
179 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  31.43 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  40.51 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
165 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  42.17 
 
 
158 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  28.57 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
165 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
174 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  43.28 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
161 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  43.28 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
193 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  38.89 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  41.33 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  37.35 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  48.21 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  40.79 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  40.79 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  40.79 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  40.79 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  42.7 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
146 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
159 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
150 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40.91 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
208 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>