More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0124 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.2 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  30.17 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 214 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 174 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  22.94 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  22.94 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  23.96 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  21.21 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0337  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03120  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.489584  hitchhiker  0.0000000819923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  26.8 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>