60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3438 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  71.14 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  37.91 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 171 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 170 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 165 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 169 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  35.57 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  35.57 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  35.57 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 		 170 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 170 aa  91.3  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 165 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  36.59 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 322 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 142 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 174 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.52 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>