148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8206 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8206  MarR family  100 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  46.26 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  44.36 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  36.84 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  34.86 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.71 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  37.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  28.05 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  28.7 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  36.99 
 
 		 92 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 184 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 167 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  27.37 
 
 		 140 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 154 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 147 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>