198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0382 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
141 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  28.24 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  28.46 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
137 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  32.61 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
201 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
171 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  30.43 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.7 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  24.44 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  26.96 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1341  transcriptional regulator, TrmB  27.61 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 
141 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  24.22 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  24.81 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.15 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
180 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  29.67 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
144 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 
296 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
156 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  25.69 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.18 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  21.05 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  23.57 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>