131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0109 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  24.31 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  27.01 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0987  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000387404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.88 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.92 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.26 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  25.9 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  24.77 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  25.37 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  32.61 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 157 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 171 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 		 142 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>