260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6557 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  308  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
171 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
178 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  29.17 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 
156 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  28 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
162 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
162 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
162 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 
173 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  28.17 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  37.93 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.38 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.51 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.51 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.51 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.51 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  31.06 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  27.15 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  26.92 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  30.51 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  29.55 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
165 aa  47.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  30.1 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>