More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2244 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  89.73 
 
 		 156 aa  267  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 173 aa  229  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.31 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.86 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.86 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  36.27 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.34 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  36 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  37.35 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  31.18 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27 
 
 		 292 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 334 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  36.59 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>