200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1533 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  283  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  66.91 
 
 
139 aa  192  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  59.42 
 
 
139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  61.59 
 
 
139 aa  174  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  27.21 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  27.48 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.53 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
162 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
135 aa  52  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
190 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
165 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  25.95 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
172 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.46 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  33.65 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
149 aa  47.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  23.88 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  28.7 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  28.97 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  27.1 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  27.1 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  27.1 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  27.1 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  27.1 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  25.83 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
166 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 
140 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  28.28 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
175 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  25 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  22.66 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  21.54 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>