181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0096 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  68.84 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 139 aa  190  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.46 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.22 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  35.09 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  25.69 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  32.61 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.51 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>