240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2560 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  68.84 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 139 aa  203  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  27.01 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.54 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  23.36 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  28.37 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.46 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  35.16 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.58 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  26.42 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.46 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  30.43 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  25.47 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  31.15 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>