195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2666 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2637  MarR family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2682  MarR family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435685  normal  0.104112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  74.19 
 
 
165 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  39.76 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
165 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
148 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
178 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  45.83 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  42.11 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
197 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  38.14 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 
194 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  35.63 
 
 
157 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
212 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
177 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
212 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
212 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
166 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  35.8 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.63 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  29.67 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  34.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  37.35 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>