More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2469 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  309  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  75.17 
 
 		 151 aa  246  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  44.44 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  45.14 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  45.14 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  45.14 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  38.06 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  36.09 
 
 		 162 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  28.57 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  26.87 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  30.6 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  27.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  31.53 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.9 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.87 
 
 		 308 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 308 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.86 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  33.01 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 177 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>