120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1332 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  28.79 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  29.69 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  24.81 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
167 aa  48.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  25.56 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  25.5 
 
 
180 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  23.08 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  27.59 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  28.43 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  28.74 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  30.88 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  20.63 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
195 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
163 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  24.73 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.08 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  22.92 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 
151 aa  42  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
193 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  25 
 
 
174 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  21.7 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
161 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
145 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  32.89 
 
 
137 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  24.11 
 
 
154 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  26.58 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
163 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  20.17 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  24.3 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
205 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>