More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0410 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 152 aa  304  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  37.11 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  27.68 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  26.14 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  30.69 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  32.5 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  33.7 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  28.17 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02510  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0329478  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  26.13 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  22.99 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>