297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1290 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
172 aa  342  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2307  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  43.48 
 
 
132 aa  92.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1341  transcriptional regulator, TrmB  36.55 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  21.09 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  22.01 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  19.5 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  20.78 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  25.78 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 
169 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  21.85 
 
 
167 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  31 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  20.57 
 
 
261 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
173 aa  50.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 
153 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  21.8 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  26.85 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  27.59 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  27.59 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  30.51 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  27.27 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 
144 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  31.73 
 
 
144 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 
142 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  24.39 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  25 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  23.01 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  28.72 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  23.89 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  24.39 
 
 
162 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 
156 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  23.89 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  25.93 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  22.64 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  24.55 
 
 
148 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  23.89 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  23.19 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  23.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  23.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  23.14 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  23.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  23.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  23.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>