More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1137 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  76.97 
 
 		 163 aa  231  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  32.62 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  44.44 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.07 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.47 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.58 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  31.67 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.03 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>