124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5805 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  37.14 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  30.84 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  33.33 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  32.95 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 188 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.58 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  31.82 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 186 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 186 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.04 
 
 		 338 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  30.93 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  28.32 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 188 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  32.14 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>