34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3253 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0079  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.6 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.6 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  22.52 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>