More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2768 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  284  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  61.43 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 146 aa  169  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  47.66 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  41.61 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.88 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  45.67 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 178 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  40.15 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.08 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  42.52 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  43.33 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40.91 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 156 aa  95.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  43.33 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  38.81 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  43.33 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  39.84 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  39.06 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  41.13 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  38.58 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  38.28 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  39.66 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  41.8 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 170 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 165 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 165 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>