More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0549 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  76.97 
 
 
155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  55.94 
 
 
151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  52.32 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
160 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
160 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  52.45 
 
 
153 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  46.91 
 
 
159 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 
159 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
148 aa  140  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  48.61 
 
 
162 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
144 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.86 
 
 
141 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  44.6 
 
 
166 aa  124  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
158 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  47.1 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
158 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
168 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
165 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
150 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.85 
 
 
152 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  44.67 
 
 
155 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
150 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
267 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  42.75 
 
 
143 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 
153 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
157 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  43.48 
 
 
158 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  39.31 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 
157 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  42.54 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
153 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 
165 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 
147 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
156 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
151 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.31 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  43.51 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  42.76 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  44.88 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
160 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
151 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
150 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
150 aa  111  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
150 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.88 
 
 
150 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.88 
 
 
150 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
150 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
155 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.9 
 
 
158 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
149 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.06 
 
 
152 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  44.36 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  45.86 
 
 
143 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
152 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.24 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>