125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1368 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
170 aa  319  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
163 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
146 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4346  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
258 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
155 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
162 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
326 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
340 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
340 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  27.07 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
197 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
309 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
320 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
347 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
349 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.11 
 
 
349 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0510  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
322 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  36.47 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.86 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
326 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
155 aa  44.3  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.64 
 
 
157 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  32.04 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0754  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  25.44 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  48.15 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0801  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0995483  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.02 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0805  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
347 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
325 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
156 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
151 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  30.65 
 
 
292 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
142 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.21 
 
 
157 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  29.41 
 
 
145 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  21.77 
 
 
138 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  27.27 
 
 
143 aa  41.6  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.87 
 
 
283 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
144 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.91 
 
 
305 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  38.57 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  32.41 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
171 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>