98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4565 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  296  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 258 aa  73.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  44.04 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.48 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.74 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.65 
 
 		 338 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4346  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02510  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 309 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0329478  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  31.31 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  28.69 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  35.29 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 179 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 161 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 197 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  30.4 
 
 		 201 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  21.64 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  28.77 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 352 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 322 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>