58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1958 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  44.71 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  37.75 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 190 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 159 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  33.64 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.78 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 157 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.56 
 
 		 157 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41.94 
 
 		 160 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  26.37 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  41.27 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 141 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 143 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 150 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  41.67 
 
 		 168 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 155 aa  42.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 174 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 186 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 152 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.27 
 
 		 186 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 180 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>