110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3035 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 153 aa  285  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 165 aa  215  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  43.16 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  33.09 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  30.93 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.82 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 340 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  34.65 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 160 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 167 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 186 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  26.62 
 
 		 158 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 173 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>