68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0415 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  91.52 
 
 		 169 aa  306  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 165 aa  304  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  75.15 
 
 		 165 aa  258  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 165 aa  253  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 165 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 172 aa  204  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  62.07 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 170 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  60.69 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  59.31 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  59.31 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  58.62 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 171 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  55.17 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  170  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  61.38 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 199 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  55.17 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.98 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  30.63 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.46 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 169 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 146 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>