67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0760 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  99.39 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  91.52 
 
 		 165 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  75.15 
 
 		 165 aa  256  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 165 aa  253  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 165 aa  250  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 190 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  63.27 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  60.69 
 
 		 171 aa  184  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 171 aa  183  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  57.93 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  57.93 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  57.24 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  53.1 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  60.69 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 199 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 199 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  47.88 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.98 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  32.43 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 99 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 144 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>