More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5023 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  287  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  86.86 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  66.12 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  64.75 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  59.84 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  59.84 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  54.14 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  56.2 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  55.37 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  53.72 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  52.76 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  34.75 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  29.91 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 180 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 180 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  37.97 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  51.06 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.32 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>