104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6320 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 187 aa  376  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 292 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  36.47 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.07 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  30.25 
 
 		 312 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.44 
 
 		 325 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  24.72 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.16 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1973  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00891975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 322 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 166 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 166 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 157 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 189 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 164 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1623  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 94 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  28.89 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 411 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 		 142 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 143 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>