97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0771 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
138 aa  277  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  97.25 
 
 
139 aa  214  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  72.46 
 
 
145 aa  192  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  62.6 
 
 
144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  59.7 
 
 
145 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 
155 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
142 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  48.44 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 
141 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  42.52 
 
 
149 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
160 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
152 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
137 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  40.65 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0718  MarR family transcriptional regulator  87.5 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  34.15 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  38.66 
 
 
277 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
175 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 
175 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  50 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
189 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
155 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 
147 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
160 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.19 
 
 
175 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
178 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.67 
 
 
325 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  38.54 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  38.32 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
148 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>