More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6567 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  290  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  63.31 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
137 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  58.59 
 
 
137 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  61.48 
 
 
139 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  57.36 
 
 
137 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 
141 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  56.59 
 
 
137 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 
141 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 
141 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  55.97 
 
 
160 aa  157  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
160 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  59.5 
 
 
137 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
151 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
137 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
137 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  60.33 
 
 
169 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 
139 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  57.03 
 
 
137 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  58.2 
 
 
158 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  58.2 
 
 
158 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  58.54 
 
 
139 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  58.2 
 
 
145 aa  151  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  58.2 
 
 
145 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  54.92 
 
 
151 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  57.63 
 
 
138 aa  141  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  48.39 
 
 
135 aa  130  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50.86 
 
 
277 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
144 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
156 aa  115  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
162 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 
149 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
160 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  28.18 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.63 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
153 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  32 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.73 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.73 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  41.56 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  26.27 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  42.11 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>