215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2430 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  77.04 
 
 		 145 aa  219  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  77.04 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  66.93 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  62.96 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  62.96 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  66.12 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  63.93 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  59.54 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  61.6 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  57.81 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  59.54 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 277 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  46.4 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  42.15 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  37.66 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.84 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  33.03 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  51.02 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30.25 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.94 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  41.79 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.62 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  24.3 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  41.43 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  23.36 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.26 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>