176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6375 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  66.93 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  64.52 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  64.52 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  64.75 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 141 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  64.8 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  65.32 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  64 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  64 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  64 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  64 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 169 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 137 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 160 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  62.07 
 
 		 138 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  49.57 
 
 		 277 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  36.67 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 329 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>